Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms