Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPSEQ9Y251 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPSEQ9Y251 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms