Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApipQ9WVQ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApipQ9WVQ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms