Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme3Q9WV85 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme3Q9WV85 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms