Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms