Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus1Q9WU56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms