Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX13Q9UN79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX13Q9UN79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms