Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C4Q9UKN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4Q9UKN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms