Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA1Q9UIW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA1Q9UIW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA1Q9UIW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.1 ms