Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry2Q9R194 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cry2Q9R194 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms