Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxe3Q9QY14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxe3Q9QY14 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms