Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx8Q9QXV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms