Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms