Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC17Q9NVM6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms