Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF19Q9NS68 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms