Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL1RAPQ9NPH3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms