Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX2Q9NPC8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms