Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MID1IP1Q9NPA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms