Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCX3AQ9NNX9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms