Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vstm2bQ9JME9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm2bQ9JME9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm2bQ9JME9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms