Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PnkpQ9JLV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms