Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nova1Q9JKN6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nova1Q9JKN6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nova1Q9JKN6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms