Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Riox1Q9JJF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms