Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1fQ9JIS7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms