Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PREBQ9HCU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms