Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms