Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLSTN2Q9H4D0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms