Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tfcp2Q9ERA0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfcp2Q9ERA0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms