Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem239Q9DA47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms