Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms