Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tube1Q9D6T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tube1Q9D6T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms