Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab3Q9D6J4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab3Q9D6J4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Necab3Q9D6J4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms