Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227bQ9D518 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227bQ9D518 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms