Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramef12Q9D2F1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms