Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl34Q9D1R9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl34Q9D1R9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms