Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca7Q9D0M2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms