Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrto4Q9D0I8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrto4Q9D0I8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mrto4Q9D0I8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms