Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mis18aQ9CZJ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis18aQ9CZJ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms