Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp11Q9CZJ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms