Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc8Q9CYA6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms