Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpvQ9CXS4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpvQ9CXS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpvQ9CXS4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms