Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms