Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msmo1Q9CRA4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msmo1Q9CRA4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Msmo1Q9CRA4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msmo1Q9CRA4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms