Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc96Q9CR92 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.1 ms