Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2Q9CQP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms