Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nudt21Q9CQF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudt21Q9CQF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudt21Q9CQF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms