Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms