Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NepnQ9CQ76 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NepnQ9CQ76 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NepnQ9CQ76 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NepnQ9CQ76 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NepnQ9CQ76 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NepnQ9CQ76 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NepnQ9CQ76 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms