Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mid1ip1Q9CQ20 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms