Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHCBP1LQ9BZQ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms